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lammps编译手册包

lammps编译手册包

版本

  • 软件大小:5 MB
  • 软件语言:简体中文
  • 软件类型:国产软件
  • 软件授权:免费软件
  • 更新时间:2017-03-15
  • 软件类别:教育教学
  • 应用平台:WinXP,Win7,Win8,windows10,其他
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5 MB

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这是lammps编译手册包,可以翻译为大规模原子分子并行模拟器,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作,一般来讲,分子动力学所涉及到的领域,LAMMPS代码也都涉及到。

软件介绍

LAMMPS即Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator,可以翻译为大规模原子分子并行模拟器,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作,一般来讲,分子动力学所涉及到的领域,LAMMPS代码也都涉及到了。 LAMMPS由美国Sandia国家实验室开发,以GPL licence发布,即开放源代码且可以免费获取使用,这意味着使用者可以根据自己的需要自行修改源代码。LAMMPS可以支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系,并提供支持多种势函数

软件特点

    支持并行计算
  分布式内存MPI
  spatial-decomposition of simulation domain for parallelism
  代码开源
  C++可拓展性好
  optional libraries used: MPI and single-processor FFT
  easy to extend with new features and functionality
  runs from an input script
  syntax for defining and using variables and formulas
  syntax for looping over runs and breaking out of loops
  run one or multiple simulations simultaneously (in parallel) from one script
 

相关介绍

LAMMPS是一个经典的分子动力学代码,他可以模拟液体中的粒子,固体和汽体的系综。他可以采用不同的力场和[url=http://baike.sogou.com/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=275891]边界条件[/url]来模拟全原子,聚合物,生物,金属,粒状和粗料化体系。LAMMPS可以计算的体系小至几个粒子,大到上百万甚至是上亿个粒子
LAMMPS可以在单个处理器的台式机和笔记本本上运行且有较高的计算效率,但是它是专门为并行计算机设计的。他可以在任何一个按装了[url=http://baike.sogou.com/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=126505]C++编译器[/url]和MPI的平台上运算,这其中当然包括分布式和共享式并行机和Beowulf型的集群机。
LAMMPS是一可以修改和扩展的计算程序,比如,可以加上一些新的力场,[url=http://baike.sogou.com/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=63367631]原子模型[/url],边界条件和诊断功能等。
通常意义上来讲,LAMMPS是根据不同的边界条件和初始条件对通过短程和[url=http://baike.sogou.com/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=10566930]长程力[/url]相互作用的分子,原子和宏观粒子集合对它们的牛顿运动方程进行积分。高效率计算的LAMMPS通过采用相邻清单来跟踪他们邻近的粒子。这些清单是根据粒子间的短程互拆力的大小进行优化过的,目的是防止局部[url=http://baike.sogou.com/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=68858673]粒子密度[/url]过高。在并行机上,LAMMPS采用的是空间分解技术来分配模拟的区域,把整个模拟空间分成较小的三维小空间,其中每一个小空间可以分配在一个处理器上。各个处理器之间相互通信并且存储每一个小空间边界上的”[url=http://baike.sogou.com/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=64793514]ghost[/url]”原子的信息。LAMMPS(并行情况)在模拟3维矩行盒子并且具有近均一密度的体系时效率最高。

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