蛋白和核酸等大分子三维结构浏览器Protein Explorer
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这是蛋白和核酸等大分子三维结构浏览器Protein Explorer，显示蛋白和核酸等大分子三维结构的免费浏览器插件，是RASMOL衍生出的软件，速度快。
Protein Explorer is free software for visualizing the three-dimensional structures of protein， DNA， and RNA macromolecules， and their interactions and binding of ligands， inhibitors， and drugs. It is arguably the easiest-to-use software of its kind. It is suitable for high school and college students (ages 16 years and older)， yet it is also widely used by graduate students and researchers.
蛋白质是由氨基酸为单位的，而核酸有DNA和RNA两种，RNA又分三类（tRNA，rRNA，mRNA）。咱们换个方式说吧，将蛋白质的产生过程说一下，你就会知道它俩的区别。首先，DNA（螺旋的梯子）一般在细胞核中，在解旋酶的作用下，氢键（梯子）断开，DNA分成了两个单链，然后再RNA聚合酶的作用下，A，C，G，U（RNA原料）分别和DNA的T，G，C，A配对，合成初级mRNA，然后初级mRNA经加工后出核孔，到细胞质中，然后它与核糖体（蛋白质与rRNA构成）结合，此时tRNA搬运着氨基酸到核糖体上形成肽链，肽链经特定氨基酸引物从内质网的孔进入内质网（即不穿膜），在内质网中加工后以小泡的形式到高尔基体加工（加糖基，折叠等）候成为成熟的蛋白质，即一般的蛋白质。蛋白质是由氨基酸为单位的（就是人们口中常说的氨基酸），核酸是以A，G，C，U，T为基本单位的。
1.用户向Shell发出页面请求后，页面的URL或本地文件名被发送到Shell；
2.Shell调用IO组件，把URL传达到IO组件；
3.IO组件使用HTTP协议或再调用本地IO获取HTML/XHTML源数据，返回Shell；
4.Shell把IO返回的HTML/XHTML source提交HTML/XHTML分析器；
5.HTML/XHTML分析器分析HTML/XHTML代码，构建一棵DOM树，树根为HTMLDocument;
6.遍历DOM树，发现是可视化元素的时(Form等为非可视化元素，div，table，button等为可视化元素)，请求布局管理器为这一个可视化元素分配一席之地，以让它安身。可视化元素只能建议布局管理器，它想要什么样的位置，大小，最终分配的实际位置，大小等由布局管理器决定，并不是由元素本身决定，它只能对布局管理器提出建议。比如在一个被设定宽度为100的Table中，某的单元格想要分配宽度为200的单元格，布局管理器就不会一定给它分配这么大，因为该单元格超出了表格的宽度。
7.当布局管理器对可视化元素指派好位置，大小后，它就就知道了它的安身之处，也记住了它的大小，它必须要严格遵守布局管理器给它分配的位置，大小，不能擅自更改。既然知道了自己的位置，大小，剩下的就是控件根据自己的属性进行表现自己了，背景，外形等。
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