NTSYS-pc(生物形态研究软件)
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这是NTSYS-pc(生物形态研究软件)，是生物形态软件，NTSYSpc可用于研究多元数据的形式和结构。例如使用者可以用来研究数据点样本，这些样本可能来自两个或多个不同的群体，或者使用邻接法或UPGMA方法构建聚类图来评估进化树.同样可以用于发现某些子集中的变异是相互关联的.NTSYS于60年代开发，经过多年的更新，现在NTSYS的功能已经非常强大了。
1、相似性和差异性：关联、距离、34个关联系数和11个遗传距离系数。
2、聚类：UPGMA和其他等级结构的SAHN方法（可以是多重关系）、邻接法和共同树的几种形式。
3、图论方法：最短长度的生成树和用邻接法绘制图片（可以是无根系统树）。
4、 排序：主成分或主坐标分析、对应分析、度量与非度量多维尺度分析、奇异值分析和Burnaby方法、典型分布随机分析、方案的多因素分析、常见的主成分分析、偏最小二乘、多关联性和典型相关。
5、图片互动：表征图、物种树、二维散点图，相似性和差异性矩阵的对比、傅立叶的大纲图、Procrustes绘图和三维视点绘图。
6、多变量测试：典型变量分析、协方差矩阵测试、维数测试、广义多元回归分析。同时还有辅导程序和模拟实验内容。
7、几何形态测量：包括Procrustes分析的特殊组件，用于叠加重点结构，绘制Procrutes分析的结果图片，绘制轮廓图片和轮廓形状的傅立叶系数（包括2D和3D椭圆图片）和部分2D和3D的弯曲系数并估算统一部分。
8、其他：由同表象相关、Mantel测试，3-way Mantel测试，数据标准化和矩阵转化等进行矩阵对比。矩阵可分割或合并。
关于ntsyspc的使用，由于专业性强，小编也不敢在这里班门弄斧，但是为了帮助大家学习，小编还是花功夫在网上找了一下比较简单的教程，打包在压缩包内，需要的朋友请仔细阅读！！
输 入的内容可以是描述性的信息，关于物种集合或直接衡量两个物种之间的相同点或不同点。说明词的种类和对象取决于应用——形态特征，大量物种，属性的出现和 缺乏等等。NTSYSpc能转换数据，估算相同或不同的物体，并且还可以运用聚类分析，排列和多因素分析来总结物种间的关系。大多数结果可以以数字和图片 的形式显示。这款软件既可以用于教学也可以用于科研。
NTSYSpcforWindows2.2的版本比起之前的版本使用更简单，功能更强大.NTSYSpc有一个交互模式(填表格的形式)和简单命令语言的批处理模式(对于分析模拟和多个数据集非常有帮助).NTSYSpc在 充分利用Windows环境的优势，允许长文件名和处理大型数据集.绘图选项窗口可以让您定制您自己的图表型（如:标题、字体、大小、颜色、规模、线 宽、背景颜色、边距和其它选项）。还可以打印预览图表。NTS数据文件是ASCII文件可以和其他软件共享，同时还支持长段文字的输入。类似于电子表格的 数据编辑器让您创建和编辑数据文件更为简便了。NTSYSpc还可以作为ASCII文本编辑器来编辑大型文件。矩阵可以用过ExcelXLS和CSV文 件阅读，数据树可以通过关联文件的一个形式进行阅读。另外还有导出MATLABM文件的选项。
生物多序列研究SeaView：这是生物多序列研究SeaView，图形化多序列比对编辑器,能够读各种比对格式(MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE),可手动编辑队列
蛋白质研究DeNovoGUI：这是蛋白质研究DeNovoGUI，一个非常复杂的领域，要求两个训练有素的专业人才和先进的数字工具。在定量方法，在性质上尤其是统计的兴起，导致依赖于用于分析肽项目水平的提高。
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