Bioedit(分子生物学应用软件)
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这是Bioedit(分子生物学应用软件),是一个功能齐全的免费分子生物学应用软件,可以完成核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作,如:序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等。与 DNAMAN 相比,其分析内容相对更丰富一些,而且提供了很多网络程序的分析界面和接口。
可以完全核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作
序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等
与 DNAMAN 相比
其分析内容相对更丰富一些
怎么利用bioedit做序列的比较
利用bioedit做序列比较
而且提供了很多网络程序的分析界面和接口
首先要把所有的序列复制到windows自带的记事本中,全部以fasta格式存到同一个文件中,保存成*.txt,序列内部最好不要有空格或者换行。
序列格式举例如下:
“>序列1 ATCG..........ATCG
>序列2 ATCG..........ATCG
>序列3 ATCG..........ATCG
>序列4 ATCG..........ATCG”
然后用Bioedit打开刚才保存的文件*.txt,点击窗口上方的Accessory application菜单,再点击clustelW multiple alignment,这时候会弹出一个窗口,直接选择Run clustalW,又弹出一个窗口,选择ok,等待结果就行了。
最后的比对结果可以保存成*.fas格式,适用于各种分析。
先行安装原英文版软件,再安装本简体中文包后运行主程序即可!
本简体中文语言包是在7.0.1基础上汉化的,同时也可以使用于各个版本的BioEdit。因采用外挂语言包形式,故软件中仍有不少地方显示为英文。
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